基于生物信息学途径探究肝细胞癌的关键基因
【目的】采用生物信息学方法探究肝细胞癌（HCC）发生的关键基因，望有助于了解HCC发生发展的分子机制。【方法】从GEO数据库中选择基因表达谱GSE76427，该数据集包含115例肝癌组织样本和52例肝癌临近非肿瘤组织样本。通过GEO2R工具在线分析，筛选出肝癌组织中差异表达基因（DEG），利用GO数据库获取DEG的功能注释，利用KEGG数据库进行通路富集分析。基于STRING数据库，利用MCC算法，筛选具有高度连接性的关键基因,基于TCGA数据库在线软件分析关键基因的预后效应。【结果】共筛选出190个DEG，其中，上调基因有16个，下调基因有174个。功能富集分析显示，下调的差异基因显著富集于...
Saved in:
| Main Authors: | , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | zho |
| Published: |
Editorial Office of Journal of Sun Yat-sen University
2018-01-01
|
| Series: | Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban |
| Subjects: | |
| Online Access: | http://xuebaoyx.sysu.edu.cn/zh/article/43566415/ |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|