食管鳞状细胞癌肿瘤组织内菌群检测及特征分析

目的分析食管鳞癌患者(ESCC组)与健康对照组(HC组)肿瘤组织菌群多样性,筛选出食管鳞癌患者肿瘤组织中特异性细菌。方法收集105例食管鳞癌患者肿瘤组织标本和54例健康对照者的食管组织标本,提取标本总DNA,用PCR方法扩增16S rDNA V4区,后行高通量测序,将数据做OTU聚类及多样性分析筛选食管鳞癌组织内特征菌。最后用定量PCR(Q-PCR)扩增方法验证筛选结果。结果多样性分析表明ESCC组肿瘤标本和HC组正常食管组织标本内菌群多样性及组成存在明显差异,物种分析表明ESCC组以梭杆菌属(<italic>Fusobacterium</italic>)、孪生球菌属(...

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Main Authors: 冼博鸿, 位俊敏, 乔贵宾, 陈晓辉, 徐方平, 骆新兰, 陈翼翔, 李子俊
Format: Article
Language:zho
Published: Editorial Office of Journal of Sun Yat-sen University 2022-05-01
Series:Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban
Subjects:
Online Access:http://xuebaoyx.sysu.edu.cn/zh/article/doi/10.13471/j.cnki.j.sun.yat-sen.univ(med.sci).2022.0316/
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