مطالعه تنوع کلروپلاستی برخی ژنوتیپهای سیب شمال غرب ایران در مقایسه با برخی ژنوتیپهای البرز مرکزی، ارقام و پایه‌های تجاری
سابقه و هدف: سیب یکی از مهم‌ترین محصولات میوه‌ای مناطق معتدله می‌باشد. کشت و کار این محصول از زمان‌های بسیار دور در ایران انجام می‌شد و حتی برخی منابع، ایران را یکی از زادگاه‌های این گیاه نامیده‌اند. جمع‌آوری و ارزیابی ذخایر ژرم پلاسم داخلی و خارجی، اساسی‌ترین مرحله در برنامه‌های بهنژادی درختان میوه...
Saved in:
| Main Authors: | , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | fas |
| Published: |
Gorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resources
2018-08-01
|
| Series: | Pizhūhish/hā-yi tulīd-i giyāhī |
| Subjects: | |
| Online Access: | https://jopp.gau.ac.ir/article_4251_add5ad02dd7cddbececeaceca1b09791.pdf |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| _version_ | 1832586672379789312 |
|---|---|
| author | شاهین جهانگیرزاده خیاوی معصومه عاشورپور شب ناز کشاورزی |
| author_facet | شاهین جهانگیرزاده خیاوی معصومه عاشورپور شب ناز کشاورزی |
| author_sort | شاهین جهانگیرزاده خیاوی |
| collection | DOAJ |
| description | سابقه و هدف: سیب یکی از مهم‌ترین محصولات میوه‌ای مناطق معتدله می‌باشد. کشت و کار این محصول از زمان‌های بسیار دور در ایران انجام می‌شد و حتی برخی منابع، ایران را یکی از زادگاه‌های این گیاه نامیده‌اند. جمع‌آوری و ارزیابی ذخایر ژرم پلاسم داخلی و خارجی، اساسی‌ترین مرحله در برنامه‌های بهنژادی درختان میوه می‌باشد. اصلاح درختان سیب، امروزه با توجه به اهمیت تغذیه سالم و تولید پایدار میوه با کیفیت بیشتر سیب، بر پایه ژن‌های مقاومت می‌باشد. با توجه به اینکه اکثر واریته‌های سیب به صورت رویشی تکثیر می‌گردند، تنوع ژنتیکی کمی مورد انتظار می‌باشد؛ اما در مورد ژنوتیپهای بومی که حاصل انتخاب ویژگی‌های برتر می‌باشند، این تنوع مورد انتظار افزایش می‌یابد زیرا این ژنوتیپ‌ها اکثراً نتاج بذری می‌باشند. در این تحقیق سعی شده است نسبت به بررسی تنوع ژنتیکی اندامکی برخی ژنوتیپهای بومی سیب مربوط به مناطق کاشت عمده این محصول در شمال غرب ایران و البرز مرکزی و مقایسه آن‌ها با دو رقم تجاری رد دلیشز و فوجی و دو پایه M4 و M9، اقدام گردد. مواد و روش‌ها: به‌منظور انجام این تحقیق، نمونه‌برداری از برگ‌های جوان و کاملاً توسعه یافته صورت گرفت و DNA ژنومی آن‌ها استخراج شد. برای بررسی تنوع اندامکی، 30 نمونه سیب، چهار جفت آغازگر اختصاصی برای ژنوم کلروپلاست (K1K2، CS، HK و TF) و دو آنزیم برشی (EcoRI و MseI) در روش چندشکلی شکافتن قطعات تکثیر شده (CAP) بکار برده شد. برنامه‌های NTSYS و POPGENE برای آنالیز داده‌ها، مورد استفاده قرار گرفتند. یافته‌ها: از بین این چهار نشانگر بکار برده شده، سه نشانگر دارای قدرت تکثیر مناسب بودند که در کل، 13/4 درصد کل ژنوم کلروپلاست سیب را تکثیر نمودند. با بررسی هاپلوتایپی نمونه‌ها، در مجموع هشت هاپلوتایپ شناسایی شد که هاپلوتایپ H4 با پوشش 66/26 درصد از کل نمونه‌ها، بزرگترین گروه بود. تمام این گروه‌بندی‌ها به دلیل رخ دادن جهش‌‌های حذف و اضافه ایجاد شده بود. حداکثر تنوع ژنتیکی (Ht)، میانگین تنوع بین جمعیتی (Hs) و تفاوت ژنتیکی بین جمعیت‌ها (Gstc) به ترتیب 467/0، 4451/0 و 0481/0 بدست آمد. نتیجه‌گیری: نتایج این بررسی نشان داد که هیچ‌گونه ساختار ژنتیکی مدونی مابین نمونه‌های مناطق مورد بررسی وجود ندارد؛ همچنین این نتایج تأیید نمودند که امکان کاربرد روش چندشکلی شکافتن قطعات تکثیر شده برای شناسایی ژنوتیپهای سیب و ارقام آن وجود دارد. با استفاده از این نشانگرها، تنوع ژنتیکی در DNA اندامکی بین ژنوتیپهای سیب مشاهده شد اما این تنوع به‌گونه‌ای نبود که قادر باشد ژنوتیپهای مناطق مختلف را از هم منفک نماید. به نظر می‌رسد شاید با افزایش تعداد آغازگرها و آنزیم‌های برشی، بتوان به این تفکیک دست‌یافت. همچنین نتایج این بررسی نشان داد که ژنوتیپهای سیب بومی ایران به دلیل آنکه اکثراً درگذشته به‌صورت جنسی تکثیر شده‌اند، دارای تنوع ژنتیکی بالایی می‌باشند. |
| format | Article |
| id | doaj-art-c4e8d7f0041c4f909e1e15835ced44a6 |
| institution | Kabale University |
| issn | 2322-2050 2322-2778 |
| language | fas |
| publishDate | 2018-08-01 |
| publisher | Gorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resources |
| record_format | Article |
| series | Pizhūhish/hā-yi tulīd-i giyāhī |
| spelling | doaj-art-c4e8d7f0041c4f909e1e15835ced44a62025-01-25T06:52:20ZfasGorgan University of Agricultural Sciences and Natural ResourcesPizhūhish/hā-yi tulīd-i giyāhī2322-20502322-27782018-08-0125211510.22069/jopp.2018.9335.22024251مطالعه تنوع کلروپلاستی برخی ژنوتیپهای سیب شمال غرب ایران در مقایسه با برخی ژنوتیپهای البرز مرکزی، ارقام و پایه‌های تجاریشاهین جهانگیرزاده خیاوی0معصومه عاشورپور1شب ناز کشاورزی2پژوهشکده چای، مؤسسه تحقیقات علوم باغبانی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، لاهیجان، ایرانجهاد کشاورزی شهرستان رشتگروه شیمی آلی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد علوم و تحقیقات، تهران ایرانسابقه و هدف: سیب یکی از مهم‌ترین محصولات میوه‌ای مناطق معتدله می‌باشد. کشت و کار این محصول از زمان‌های بسیار دور در ایران انجام می‌شد و حتی برخی منابع، ایران را یکی از زادگاه‌های این گیاه نامیده‌اند. جمع‌آوری و ارزیابی ذخایر ژرم پلاسم داخلی و خارجی، اساسی‌ترین مرحله در برنامه‌های بهنژادی درختان میوه می‌باشد. اصلاح درختان سیب، امروزه با توجه به اهمیت تغذیه سالم و تولید پایدار میوه با کیفیت بیشتر سیب، بر پایه ژن‌های مقاومت می‌باشد. با توجه به اینکه اکثر واریته‌های سیب به صورت رویشی تکثیر می‌گردند، تنوع ژنتیکی کمی مورد انتظار می‌باشد؛ اما در مورد ژنوتیپهای بومی که حاصل انتخاب ویژگی‌های برتر می‌باشند، این تنوع مورد انتظار افزایش می‌یابد زیرا این ژنوتیپ‌ها اکثراً نتاج بذری می‌باشند. در این تحقیق سعی شده است نسبت به بررسی تنوع ژنتیکی اندامکی برخی ژنوتیپهای بومی سیب مربوط به مناطق کاشت عمده این محصول در شمال غرب ایران و البرز مرکزی و مقایسه آن‌ها با دو رقم تجاری رد دلیشز و فوجی و دو پایه M4 و M9، اقدام گردد. مواد و روش‌ها: به‌منظور انجام این تحقیق، نمونه‌برداری از برگ‌های جوان و کاملاً توسعه یافته صورت گرفت و DNA ژنومی آن‌ها استخراج شد. برای بررسی تنوع اندامکی، 30 نمونه سیب، چهار جفت آغازگر اختصاصی برای ژنوم کلروپلاست (K1K2، CS، HK و TF) و دو آنزیم برشی (EcoRI و MseI) در روش چندشکلی شکافتن قطعات تکثیر شده (CAP) بکار برده شد. برنامه‌های NTSYS و POPGENE برای آنالیز داده‌ها، مورد استفاده قرار گرفتند. یافته‌ها: از بین این چهار نشانگر بکار برده شده، سه نشانگر دارای قدرت تکثیر مناسب بودند که در کل، 13/4 درصد کل ژنوم کلروپلاست سیب را تکثیر نمودند. با بررسی هاپلوتایپی نمونه‌ها، در مجموع هشت هاپلوتایپ شناسایی شد که هاپلوتایپ H4 با پوشش 66/26 درصد از کل نمونه‌ها، بزرگترین گروه بود. تمام این گروه‌بندی‌ها به دلیل رخ دادن جهش‌‌های حذف و اضافه ایجاد شده بود. حداکثر تنوع ژنتیکی (Ht)، میانگین تنوع بین جمعیتی (Hs) و تفاوت ژنتیکی بین جمعیت‌ها (Gstc) به ترتیب 467/0، 4451/0 و 0481/0 بدست آمد. نتیجه‌گیری: نتایج این بررسی نشان داد که هیچ‌گونه ساختار ژنتیکی مدونی مابین نمونه‌های مناطق مورد بررسی وجود ندارد؛ همچنین این نتایج تأیید نمودند که امکان کاربرد روش چندشکلی شکافتن قطعات تکثیر شده برای شناسایی ژنوتیپهای سیب و ارقام آن وجود دارد. با استفاده از این نشانگرها، تنوع ژنتیکی در DNA اندامکی بین ژنوتیپهای سیب مشاهده شد اما این تنوع به‌گونه‌ای نبود که قادر باشد ژنوتیپهای مناطق مختلف را از هم منفک نماید. به نظر می‌رسد شاید با افزایش تعداد آغازگرها و آنزیم‌های برشی، بتوان به این تفکیک دست‌یافت. همچنین نتایج این بررسی نشان داد که ژنوتیپهای سیب بومی ایران به دلیل آنکه اکثراً درگذشته به‌صورت جنسی تکثیر شده‌اند، دارای تنوع ژنتیکی بالایی می‌باشند.https://jopp.gau.ac.ir/article_4251_add5ad02dd7cddbececeaceca1b09791.pdfmalusهاپلوتایپچندشکلی شکافتن قطعات تکثیرشده (cap)پرایمر عمومی کلروپلاستآنزیم برشی |
| spellingShingle | شاهین جهانگیرزاده خیاوی معصومه عاشورپور شب ناز کشاورزی مطالعه تنوع کلروپلاستی برخی ژنوتیپهای سیب شمال غرب ایران در مقایسه با برخی ژنوتیپهای البرز مرکزی، ارقام و پایه‌های تجاری Pizhūhish/hā-yi tulīd-i giyāhī malus هاپلوتایپ چندشکلی شکافتن قطعات تکثیرشده (cap) پرایمر عمومی کلروپلاست آنزیم برشی |
| title | مطالعه تنوع کلروپلاستی برخی ژنوتیپهای سیب شمال غرب ایران در مقایسه با برخی ژنوتیپهای البرز مرکزی، ارقام و پایه‌های تجاری |
| title_full | مطالعه تنوع کلروپلاستی برخی ژنوتیپهای سیب شمال غرب ایران در مقایسه با برخی ژنوتیپهای البرز مرکزی، ارقام و پایه‌های تجاری |
| title_fullStr | مطالعه تنوع کلروپلاستی برخی ژنوتیپهای سیب شمال غرب ایران در مقایسه با برخی ژنوتیپهای البرز مرکزی، ارقام و پایه‌های تجاری |
| title_full_unstemmed | مطالعه تنوع کلروپلاستی برخی ژنوتیپهای سیب شمال غرب ایران در مقایسه با برخی ژنوتیپهای البرز مرکزی، ارقام و پایه‌های تجاری |
| title_short | مطالعه تنوع کلروپلاستی برخی ژنوتیپهای سیب شمال غرب ایران در مقایسه با برخی ژنوتیپهای البرز مرکزی، ارقام و پایه‌های تجاری |
| title_sort | مطالعه تنوع کلروپلاستی برخی ژنوتیپهای سیب شمال غرب ایران در مقایسه با برخی ژنوتیپهای البرز مرکزی، ارقام و پایه‌های تجاری |
| topic | malus هاپلوتایپ چندشکلی شکافتن قطعات تکثیرشده (cap) پرایمر عمومی کلروپلاست آنزیم برشی |
| url | https://jopp.gau.ac.ir/article_4251_add5ad02dd7cddbececeaceca1b09791.pdf |
| work_keys_str_mv | AT sẖạhynjhạngyrzạdhkẖyạwy mṭạlʿhtnwʿḵlrwplạstybrkẖyzẖnwtyphạysybsẖmạlgẖrbạyrạndrmqạyshbạbrkẖyzẖnwtyphạyạlbrzmrḵzyạrqạmwpạyhhạytjạry AT mʿṣwmhʿạsẖwrpwr mṭạlʿhtnwʿḵlrwplạstybrkẖyzẖnwtyphạysybsẖmạlgẖrbạyrạndrmqạyshbạbrkẖyzẖnwtyphạyạlbrzmrḵzyạrqạmwpạyhhạytjạry AT sẖbnạzḵsẖạwrzy mṭạlʿhtnwʿḵlrwplạstybrkẖyzẖnwtyphạysybsẖmạlgẖrbạyrạndrmqạyshbạbrkẖyzẖnwtyphạyạlbrzmrḵzyạrqạmwpạyhhạytjạry |