基于泛基因组学和消减蛋白质组学挖掘新型抗诺卡氏菌药物靶点
目的诺卡氏菌是一种病原体，可引起人体的机会性感染，呈全球性分布。近年来发现诺卡氏菌对常用药物已产生耐药性，因此，挖掘新抗诺卡氏菌药物靶点、开发新药物具有迫切需求。方法取GenBank数据库中31株诺卡氏菌的全基因组序列，利用BPGA进行泛基因组学分析，利用消减蛋白组学筛选药物靶点。在此基础上，同源建模预测靶点蛋白的3D结构，采用DrugBank对靶点蛋白进行潜在药物的预测，并使用分子对接技术验证药物与靶点的结合活性。结果31株诺卡氏菌的泛基因组中有1 421个核心蛋白，消减蛋白组学分析获得15个候选药物靶点蛋白。其中，OG1493蛋白的理化性质（氨基酸数目、分子量、等电点、总平均亲水性、脂肪指...
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| Main Authors: | , , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | zho |
| Published: |
Editorial Office of Journal of Sun Yat-sen University
2023-11-01
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| Series: | Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban |
| Subjects: | |
| Online Access: | http://xuebaoyx.sysu.edu.cn/zh/article/doi/10.13471/j.cnki.j.sun.yat-sen.univ(med.sci).2023.0611/ |
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