Kloramfenikol Aptameri Fonksiyonlandırılmış DNA Hidrojellerinin Sentez Koşullarının Optimizasyonu
Aptamer fonksiyonlandırılmış DNA hidrojelleri yüksek özgünlük, stabilite ve esneklik gibi özellikleri nedeniyle birçok alanda kullanılmaktadır. Bu çalışma kapsamında kloramfenikole özgü aptamer dizisi fonksiyonlandırılmış DNA hidrojeli sentezi gerçekleştirilmiş ve hidrojel stabilitesi için önemli pa...
Saved in:
| Main Authors: | , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | English |
| Published: |
Çanakkale Onsekiz Mart University
2023-03-01
|
| Series: | Journal of Advanced Research in Natural and Applied Sciences |
| Subjects: | |
| Online Access: | https://dergipark.org.tr/en/download/article-file/2613313 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| _version_ | 1832095470101463040 |
|---|---|
| author | Gülnur Camızcı Aran Ceren Bayraç |
| author_facet | Gülnur Camızcı Aran Ceren Bayraç |
| author_sort | Gülnur Camızcı Aran |
| collection | DOAJ |
| description | Aptamer fonksiyonlandırılmış DNA hidrojelleri yüksek özgünlük, stabilite ve esneklik gibi özellikleri nedeniyle birçok alanda kullanılmaktadır. Bu çalışma kapsamında kloramfenikole özgü aptamer dizisi fonksiyonlandırılmış DNA hidrojeli sentezi gerçekleştirilmiş ve hidrojel stabilitesi için önemli parametreler optimize edilmiştir. Sentez için 5’ uçları akridit modifiyeli kloramfenikole özgü aptamer ile ona kısmen eşlenik DNA ipliği polimer yapıya yan dal olarak katılmış ve eşlenik bölgelerin hibridizasyonu ile bir arada tutularak hidrojel sentezi gerçekleştirilmiştir. Optimize edilmiş parametreler akridit modifiyeli DNA dizilerinin konsantrasyonları, akrilamid yüzdesi, kloramfenikol aptameri ve DNA iplik 1 içeren lineer polimer çözeltilerin molar oranlarıdır. Ayrıca, reaksiyon sıcaklığı ve eşlenik bölgenin uzunluğunun jel stabilitesine etkisi değerlendirilmiştir. Sonuç olarak, DNA hidrojel stabilitesi için %60’lık lineer poliakrilamid-DNA konjugasyonundan, %40 akrilamid stok çözeltisi kullanılarak 1:1 molar oranda karıştırılan aptamer ve DNA iplik çözeltileri ile 25°C’de aptamer fonksiyonlandırılmış DNA hidrojeli sentezi tamamlanmıştır. Bunlara ek olarak, aptamer dizisi ile DNA iplik arasındaki eşlenik bölgenin uzunluğunun stabiliteyi artırdığı sonucuna varılmıştır. |
| format | Article |
| id | doaj-art-4abc0f7cbde943988013bd8954c0a9be |
| institution | Kabale University |
| issn | 2757-5195 |
| language | English |
| publishDate | 2023-03-01 |
| publisher | Çanakkale Onsekiz Mart University |
| record_format | Article |
| series | Journal of Advanced Research in Natural and Applied Sciences |
| spelling | doaj-art-4abc0f7cbde943988013bd8954c0a9be2025-02-05T17:57:35ZengÇanakkale Onsekiz Mart UniversityJournal of Advanced Research in Natural and Applied Sciences2757-51952023-03-019114515710.28979/jarnas.1166311453Kloramfenikol Aptameri Fonksiyonlandırılmış DNA Hidrojellerinin Sentez Koşullarının OptimizasyonuGülnur Camızcı Aran0https://orcid.org/0000-0002-9455-0972Ceren Bayraç1https://orcid.org/0000-0003-0959-6413KARAMANOĞLU MEHMETBEY ÜNİVERSİTESİKARAMANOGLU MEHMETBEY UNIVERSITYAptamer fonksiyonlandırılmış DNA hidrojelleri yüksek özgünlük, stabilite ve esneklik gibi özellikleri nedeniyle birçok alanda kullanılmaktadır. Bu çalışma kapsamında kloramfenikole özgü aptamer dizisi fonksiyonlandırılmış DNA hidrojeli sentezi gerçekleştirilmiş ve hidrojel stabilitesi için önemli parametreler optimize edilmiştir. Sentez için 5’ uçları akridit modifiyeli kloramfenikole özgü aptamer ile ona kısmen eşlenik DNA ipliği polimer yapıya yan dal olarak katılmış ve eşlenik bölgelerin hibridizasyonu ile bir arada tutularak hidrojel sentezi gerçekleştirilmiştir. Optimize edilmiş parametreler akridit modifiyeli DNA dizilerinin konsantrasyonları, akrilamid yüzdesi, kloramfenikol aptameri ve DNA iplik 1 içeren lineer polimer çözeltilerin molar oranlarıdır. Ayrıca, reaksiyon sıcaklığı ve eşlenik bölgenin uzunluğunun jel stabilitesine etkisi değerlendirilmiştir. Sonuç olarak, DNA hidrojel stabilitesi için %60’lık lineer poliakrilamid-DNA konjugasyonundan, %40 akrilamid stok çözeltisi kullanılarak 1:1 molar oranda karıştırılan aptamer ve DNA iplik çözeltileri ile 25°C’de aptamer fonksiyonlandırılmış DNA hidrojeli sentezi tamamlanmıştır. Bunlara ek olarak, aptamer dizisi ile DNA iplik arasındaki eşlenik bölgenin uzunluğunun stabiliteyi artırdığı sonucuna varılmıştır.https://dergipark.org.tr/en/download/article-file/2613313aptamerdna hidrojelkloramfenikolaptamerdna hydrogelchloramphenicol |
| spellingShingle | Gülnur Camızcı Aran Ceren Bayraç Kloramfenikol Aptameri Fonksiyonlandırılmış DNA Hidrojellerinin Sentez Koşullarının Optimizasyonu Journal of Advanced Research in Natural and Applied Sciences aptamer dna hidrojel kloramfenikol aptamer dna hydrogel chloramphenicol |
| title | Kloramfenikol Aptameri Fonksiyonlandırılmış DNA Hidrojellerinin Sentez Koşullarının Optimizasyonu |
| title_full | Kloramfenikol Aptameri Fonksiyonlandırılmış DNA Hidrojellerinin Sentez Koşullarının Optimizasyonu |
| title_fullStr | Kloramfenikol Aptameri Fonksiyonlandırılmış DNA Hidrojellerinin Sentez Koşullarının Optimizasyonu |
| title_full_unstemmed | Kloramfenikol Aptameri Fonksiyonlandırılmış DNA Hidrojellerinin Sentez Koşullarının Optimizasyonu |
| title_short | Kloramfenikol Aptameri Fonksiyonlandırılmış DNA Hidrojellerinin Sentez Koşullarının Optimizasyonu |
| title_sort | kloramfenikol aptameri fonksiyonlandirilmis dna hidrojellerinin sentez kosullarinin optimizasyonu |
| topic | aptamer dna hidrojel kloramfenikol aptamer dna hydrogel chloramphenicol |
| url | https://dergipark.org.tr/en/download/article-file/2613313 |
| work_keys_str_mv | AT gulnurcamızcıaran kloramfenikolaptamerifonksiyonlandırılmısdnahidrojellerininsentezkosullarınınoptimizasyonu AT cerenbayrac kloramfenikolaptamerifonksiyonlandırılmısdnahidrojellerininsentezkosullarınınoptimizasyonu |