LncRNA与凋亡相关基因在小鼠肠缺血再灌后肠黏膜表达谱中的变化及共表达网络关系

LncRNA与凋亡相关基因在小鼠肠缺血再灌后肠黏膜表达谱中的变化及共表达网络关系

【目的】研究小鼠肠I/R损伤早期肠黏膜中长链非编码RNA（lncRNA）的变化，建立差异表达的lncRNA表达谱及功能角色，并对lncRNA和凋亡相关基因进行编码-非编码基因共表达（CNC）生物信息学分析。【方法】采用lncRNA芯片高通量筛选小鼠肠I/R损伤早期肠黏膜中差异lncRNA的变化并用qRT-PCR验证芯片重复性，通过对与lncRNA同时差异表达的mRNA进行基因本体论（GO）富集分析，重点分析凋亡相关功能。最后，挑选差异变化的已知凋亡相关基因的mRNA，通过CNC分析计算出与之显著相关的IncRNA-mRNA关系对，构建差异lncRNA和凋亡mRNA共表达网络。【结果】与假手术组...

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Main Authors: 许淼, 杨勇, 邓绮文, 沈建通, 刘卫锋, 杨文静, 刘克玄
Format: Article
Language:zho
Published: Editorial Office of Journal of Sun Yat-sen University 2019-01-01
Series:Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban
Subjects:
肠
缺血再灌注损伤
长链非编码RNA
凋亡
共表达分析
Online Access:http://xuebaoyx.sysu.edu.cn/zh/article/43547415/
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