利用Illumina MiSeq测序平台分析健康与腹泻食蟹猴粪样菌群
本试验通过对比健康与腹泻食蟹猴粪便菌群的差异,初步探讨腹泻对食蟹猴粪便菌群的影响。采集成年腹泻与健康食蟹猴粪样各6份,用细菌16Sr DNA通用引物扩增V3—V4 区,采用Illumina MiSeq测序平台对食蟹猴粪便微生物进行研究。结果表明,Alpha多样性指数分析,健康组与腹泻组的微生物多样性指数(Shannon、Simpson)差异不显著,群落丰富度指数(Chao、Ace)差异显著。PCA主成分分析,健康组与腹泻组粪便菌群具有明显的差异。通过对健康组与腹泻组物种菌群组成分析,运用MetaStat方法分析,与健康组相比,腹泻组的芽孢杆菌纲、乳酸杆菌目、乳酸杆菌属含量显著降低(P<0...
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Format: | Article |
Language: | zho |
Published: |
Editorial Department of Chinese Journal of Wildlife
2019-01-01
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Series: | 野生动物学报 |
Subjects: | |
Online Access: | http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails?columnId=67058811&Fpath=home&index=0 |
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