مطالعه مولکولی اکوتایپ های مختلف عناب (.Ziziphus jujuba Mill )در منطقه خراسان جنوبی بر مبنای ژن‌های کلروپلاستی
سابقه و هدف: عناب Ziziphus jujuba Mill. یکی از گیاهان باغی و دارویی مهم در ایران و متعلق به خانواده Rhamnaceae است. از سال ۲۰۰۰، تحقیقات زیادی بر روابط ژنتیکی بین ارقام مختلف عناب و یا عناب وحشی با استفاده از نشانگرهای مولکولی تمرکز داشته است. تنوع ژنتیکی اکوتایپ های مختلف گونهZ. Jujuba در ایران در...
Saved in:
| Main Authors: | , , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | fas |
| Published: |
Gorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resources
2021-06-01
|
| Series: | Pizhūhish/hā-yi tulīd-i giyāhī |
| Subjects: | |
| Online Access: | https://jopp.gau.ac.ir/article_5611_d433f2eaf182ab5622906b9740813248.pdf |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Summary: | سابقه و هدف: عناب Ziziphus jujuba Mill. یکی از گیاهان باغی و دارویی مهم در ایران و متعلق به خانواده Rhamnaceae است. از سال ۲۰۰۰، تحقیقات زیادی بر روابط ژنتیکی بین ارقام مختلف عناب و یا عناب وحشی با استفاده از نشانگرهای مولکولی تمرکز داشته است. تنوع ژنتیکی اکوتایپ های مختلف گونهZ. Jujuba در ایران در سال ۲۰۰6 و در سال 2007 رده بندی درون جنس برای 19 گونه توسط آنالیز همزمان صفات ریخت شناختی و روش‌های مولکولی صورت گفته است. هدف از این مطالعه انجام DNA بارکدینگ و تجزیه و تحلیل مولکولی اکوتایپ‌های متفاوت عناب با استفاده از دو ژن کلروپلاستی rbcL و matK است.مواد و روش‌ها: برای این منظور تعداد 25 اکوتایپ عناب از استان خراسان جنوبی و پنج استان دیگر کشور مورد ارزیابی قرار گرفت. همچنین دو جنس خویشاوند نزدیک از همین خانواده (Sangoisorba sp., Rosa sp.) به عنوان گروه خارجی استفاده شد. خالص سازی (پالایش پروتئین و پلی‌ساکارید) با استفاده از روش دستی انجام شد. سپس ژل با استفاده از اتیدیوم بروماید رنگ آمیزی شده و کیفیت DNA نیز با استفاده از نتایج الکتروفورز ژل آگاروز تخمین زده شد. ژن‌های کلروپلاستی از DNA استخراج شده با استفاده از تکنیک PCR تکثیر شدند. تمام توالی‌های حاصل از خوانش فوروارد و معکوس در این مطالعه برای تولید توالی نهایی با استفاده از نرم افزار‌های مناسب سرهم شدند.یافته‌ها: بارکد DNA هر گونه برای شناسایی سریع، دقیق و خودکار گونه‌ها انجام شد و تمام توالی به دست آمده از این مطالعه به NCBI (مرکز ملی اطلاعات بیوتکنولوژی) ارسال شد و ثبت گردید. نتایج نشان می‌دهد بیشترین فاصله‌ی ژنتیکی بین اکوتایپ‌های عناب و دو نمونه از گروه خارجی وجود دارد و تنوع ژنتیکی قابل توجهی در بین اکوتایپ‌های مختلف عناب وجود ندارد و تفاوت‌های مورفولوژیکی ناشی از شرایط اکولوژیکی می‌باشد. اگرچه تحلیل داده‌های ترکیبی ژن‌ها بینش اطلاعاتی بیشتری نسبت به تحلیل جداگانه‌ی داده‌های توالی ارائه داد. طبق نتایج بیشترین تنوع در اکوتایپ‌های خراسان جنوبی مشاهده شد.نتیجه گیری: با توجه به گستره شبکه‌های هاپلوتیپی، خراسان جنوبی می‌تواند به عنوان یکی از خاستگاه‌های اصلی عناب در ایران معرفی گردد. مطالعات پیشین کاملا نتایج حاصله از این مطالعه را تأیید می‌کند. با این حال، با در نظر گرفتن اهمیت اقتصادی گیاهان عناب در جهان، ایران و به ویژه خراسان جنوبی استفاده از نمونه‌های بیشتر و ژن‌های بیشتر به خصوص ژن‌های هسته‌ای برای مطالعه‌ی دقیق‌تر شباهت‌ها و تفاوت‌های ژنتیکی این اکوتایپ‌ها پیشنهاد می‌شود. اگرچه برای دستیابی به نتایج دقیق‌تر مطالعه بر روی تعداد گونه‌های بیشتر از مناطق مختلف ایران و استفاده از ژن‌های هسته‌ای پیشنهاد می‌گردد. |
|---|---|
| ISSN: | 2322-2050 2322-2778 |