Geleneksel Yöntemle Üretilen Zeytin ve Elma Sirkesi Biyofilm Formlarındaki Bakteriyel Floranın PZR DGJE Yöntemi ile Belirlenmesi
Bu çalışmada, geleneksel yöntemle üretilmiş zeytin ve elma sirke biyofilmlerindeki bakteriyel popülasyon farklılıkları; türlerinin izolasyonu, bakteriyel 16S rRNA geninin V3 bölgesinin PZR (Polimer Zincir Reaksiyonu) amplifikasyonu ve ardından DGJE (Denatüre Edici Gradyan Jel Elektroforezi) ile PZR...
Saved in:
| Main Authors: | , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | English |
| Published: |
Hasan Eleroğlu
2023-11-01
|
| Series: | Turkish Journal of Agriculture: Food Science and Technology |
| Subjects: | |
| Online Access: | https://www.agrifoodscience.com/index.php/TURJAF/article/view/6043 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| _version_ | 1849395911000588288 |
|---|---|
| author | Burcu Oktar Uzun Aytül Bayraktar |
| author_facet | Burcu Oktar Uzun Aytül Bayraktar |
| author_sort | Burcu Oktar Uzun |
| collection | DOAJ |
| description | Bu çalışmada, geleneksel yöntemle üretilmiş zeytin ve elma sirke biyofilmlerindeki bakteriyel popülasyon farklılıkları; türlerinin izolasyonu, bakteriyel 16S rRNA geninin V3 bölgesinin PZR (Polimer Zincir Reaksiyonu) amplifikasyonu ve ardından DGJE (Denatüre Edici Gradyan Jel Elektroforezi) ile PZR DGJE (Polimeraz Zincir Reaksiyonu Denatüre Edici Gradyan Jel Elektroforez) yöntemiyle belirlenerek, DNA dizi analizleriyle tanımlanmıştır. Elde edilen diziler, BLAST (Basic Local Alignment Search Tool = Temel Bölgesel Hizalama Arama Aracı) analizi ile hizalanmıştır. Filogenetik analiz için MEGA X (Molecular Evolutionary Genetics Analysis, X) programı kullanılmıştır. Zeytin sirkesi örneklerinde Komogataeibacter rhaeticus baskın tür olarak, elma sirke örneklerinde ise sirke bakterisi olarak bilinen Komogataeibacter xylinus (Gluconacetobacter) baskın tür olarak tespit edilmiştir. Geleneksel üretim yöntemiyle üretilen sirkelerdeki bakteriyel türlerin tanımlanması ve izolasyonu ile bu bakteriler kültür olarak depolanmıştır. |
| format | Article |
| id | doaj-art-b71d94e46eaf4a4b82d70d3dee5f254b |
| institution | Kabale University |
| issn | 2148-127X |
| language | English |
| publishDate | 2023-11-01 |
| publisher | Hasan Eleroğlu |
| record_format | Article |
| series | Turkish Journal of Agriculture: Food Science and Technology |
| spelling | doaj-art-b71d94e46eaf4a4b82d70d3dee5f254b2025-08-20T03:39:28ZengHasan EleroğluTurkish Journal of Agriculture: Food Science and Technology2148-127X2023-11-0111112051205810.24925/turjaf.v11i11.2051-2058.60434744Geleneksel Yöntemle Üretilen Zeytin ve Elma Sirkesi Biyofilm Formlarındaki Bakteriyel Floranın PZR DGJE Yöntemi ile BelirlenmesiBurcu Oktar Uzun0https://orcid.org/0009-0001-9734-1631Aytül Bayraktar1https://orcid.org/0000-0002-1725-6315Ankara Üniversitesi Eczacılık Fakültesi Analitik Kimya ABD 06560 Ankara, TürkiyeSüleyman Demirel Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Kimya Mühendisliği Bölümü, 32260 Isparta, TürkiyeBu çalışmada, geleneksel yöntemle üretilmiş zeytin ve elma sirke biyofilmlerindeki bakteriyel popülasyon farklılıkları; türlerinin izolasyonu, bakteriyel 16S rRNA geninin V3 bölgesinin PZR (Polimer Zincir Reaksiyonu) amplifikasyonu ve ardından DGJE (Denatüre Edici Gradyan Jel Elektroforezi) ile PZR DGJE (Polimeraz Zincir Reaksiyonu Denatüre Edici Gradyan Jel Elektroforez) yöntemiyle belirlenerek, DNA dizi analizleriyle tanımlanmıştır. Elde edilen diziler, BLAST (Basic Local Alignment Search Tool = Temel Bölgesel Hizalama Arama Aracı) analizi ile hizalanmıştır. Filogenetik analiz için MEGA X (Molecular Evolutionary Genetics Analysis, X) programı kullanılmıştır. Zeytin sirkesi örneklerinde Komogataeibacter rhaeticus baskın tür olarak, elma sirke örneklerinde ise sirke bakterisi olarak bilinen Komogataeibacter xylinus (Gluconacetobacter) baskın tür olarak tespit edilmiştir. Geleneksel üretim yöntemiyle üretilen sirkelerdeki bakteriyel türlerin tanımlanması ve izolasyonu ile bu bakteriler kültür olarak depolanmıştır.https://www.agrifoodscience.com/index.php/TURJAF/article/view/6043sirkeasetik asit bakterisipzr-dgje tekniğimikrobiyal çeşitlilik moleküler teknikler |
| spellingShingle | Burcu Oktar Uzun Aytül Bayraktar Geleneksel Yöntemle Üretilen Zeytin ve Elma Sirkesi Biyofilm Formlarındaki Bakteriyel Floranın PZR DGJE Yöntemi ile Belirlenmesi Turkish Journal of Agriculture: Food Science and Technology sirke asetik asit bakterisi pzr-dgje tekniği mikrobiyal çeşitlilik moleküler teknikler |
| title | Geleneksel Yöntemle Üretilen Zeytin ve Elma Sirkesi Biyofilm Formlarındaki Bakteriyel Floranın PZR DGJE Yöntemi ile Belirlenmesi |
| title_full | Geleneksel Yöntemle Üretilen Zeytin ve Elma Sirkesi Biyofilm Formlarındaki Bakteriyel Floranın PZR DGJE Yöntemi ile Belirlenmesi |
| title_fullStr | Geleneksel Yöntemle Üretilen Zeytin ve Elma Sirkesi Biyofilm Formlarındaki Bakteriyel Floranın PZR DGJE Yöntemi ile Belirlenmesi |
| title_full_unstemmed | Geleneksel Yöntemle Üretilen Zeytin ve Elma Sirkesi Biyofilm Formlarındaki Bakteriyel Floranın PZR DGJE Yöntemi ile Belirlenmesi |
| title_short | Geleneksel Yöntemle Üretilen Zeytin ve Elma Sirkesi Biyofilm Formlarındaki Bakteriyel Floranın PZR DGJE Yöntemi ile Belirlenmesi |
| title_sort | geleneksel yontemle uretilen zeytin ve elma sirkesi biyofilm formlarindaki bakteriyel floranin pzr dgje yontemi ile belirlenmesi |
| topic | sirke asetik asit bakterisi pzr-dgje tekniği mikrobiyal çeşitlilik moleküler teknikler |
| url | https://www.agrifoodscience.com/index.php/TURJAF/article/view/6043 |
| work_keys_str_mv | AT burcuoktaruzun gelenekselyontemleuretilenzeytinveelmasirkesibiyofilmformlarındakibakteriyelfloranınpzrdgjeyontemiilebelirlenmesi AT aytulbayraktar gelenekselyontemleuretilenzeytinveelmasirkesibiyofilmformlarındakibakteriyelfloranınpzrdgjeyontemiilebelirlenmesi |