اعتبار سنجی برخی نشانگرهای مولکولی در تعیین جنسیت ژنوتیپ‌‌های مختلف کیوی فروت حاصل گرده افشانی آزاد
سابقه و هدف: کیوی‌فروت یکی از مهم‌ترین محصول باغی صادراتی ایران است. اما تمایل مشتریان بین المللی به خرید میوههای کیوی متفاوت از نظر رنگ گوشت و مزه افزایش یافته است، جهت ارتقای جایگاه کیوی ایران تولید ارقام جدید اهمیت دارد. یکی از موانع اصلاح نونهالی نسبتا طولانی و همچنین دوپایگی میباشد که تا قبل...
Saved in:
| Main Authors: | , , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | fas |
| Published: |
Gorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resources
2020-08-01
|
| Series: | Pizhūhish/hā-yi tulīd-i giyāhī |
| Subjects: | |
| Online Access: | https://jopp.gau.ac.ir/article_5114_7245d6da6588e13873132bbc30bba989.pdf |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| _version_ | 1832586664918122496 |
|---|---|
| author | سونیا جمالی آنجلانی محمود قاسم نژاد حبیب الله سمیع زاده لاهیجی یوسف حمیداوغلی |
| author_facet | سونیا جمالی آنجلانی محمود قاسم نژاد حبیب الله سمیع زاده لاهیجی یوسف حمیداوغلی |
| author_sort | سونیا جمالی آنجلانی |
| collection | DOAJ |
| description | سابقه و هدف: کیوی‌فروت یکی از مهم‌ترین محصول باغی صادراتی ایران است. اما تمایل مشتریان بین المللی به خرید میوههای کیوی متفاوت از نظر رنگ گوشت و مزه افزایش یافته است، جهت ارتقای جایگاه کیوی ایران تولید ارقام جدید اهمیت دارد. یکی از موانع اصلاح نونهالی نسبتا طولانی و همچنین دوپایگی میباشد که تا قبل از گلدهی تفاوتی ظاهری دانهال نر و ماده وجود ندارد. بنابراین، تعیین جنسیت دانهالها و جداسازی افراد نر و ماده در کوتاهترین زمان اهمیت زیادی در برنامههای بهنژادی دارد. در این پژوهش اعتبارسنجی برخی از نشانگرهای مولکولی مرتبط با جنسیت جهت تفکیک دانهال‌های نر و ماده کیوی‌فروت حاصل از گرده افشانی آزاد مورد آزمون قرار گرفت. مواد و روشها: در این پژوهش از دو نوع ژنوتیپ کیوی‌فروت گوشت زرد (به اسامی نواب و خورشید) و یک نوع ژنوتیپ گوشت قرمز(خونی) که همگی متعلق به گونه Actinidia chinesis و دیپلوئید بودند، استفاده شد. استخراج DNA ژنومی از برگهای جوان 10 گیاه بالغ نر و ماده بالغ کیوی‌فروت به روش CTAB با کمی تغییرات صورت گرفت. برای تعیین دقیق غلظت DNA هر نمونه، از دستگاه اسپکتروفوتومتری (Biophotometra, Plus Eppendorff) استفاده می‌شود و غلظتDNA در طول موج 260 نانومتر ارزیابی شد. واکنش زنجیرهای پلیمراز (PCR) در حجم 10 میکرولیتر با استفاده از دستگاه برای هر نمونه انجام گرفت. برای هر پرایمر برنامه (PCR)، غلظت ژل آگارز و مدت زمان بارگذاری بهینه استفاده شد. در نهایت، اعتبار سنجی برخی از نشانگرهای مولکولی مرتبط با جنسیت شامل سه نشانگر SCAR (SmY, SmX و SmY1) و سه نشانگر SSR (A00I, A00II, A00II) در DNA استخراج شده از برگ ژنوتیپ‌‌های مورد آزمایش، مورد بررسی قرار گرفت. یافتهها: نتایج این پژوهش نشان داد از بین چندین نشانگر SCAR و SSR که قبلا گزارش شده بود، برخی قادر به جداسازی دقیق دانهال‌های نر و ماده کیوی‌فروت نبودند. از بین سه نشانگر SCAR (SmY, SmX و SmY1) که مورد آزمون قرار گرفتند، تنها دو نشانگر SmY1 (770 bp) در افراد نر(بدون ظهور هیچ باندی در افراد ماده) و در افراد ماده و SmX (950bp) در افراد ماده (بدون ظهور هیچ باندی در افراد نر) به خوبی قادر به جداسازی دانهال‌های کیوی‌فروت شدند. با توجه به نوارهای چندشکل بدست آمده از سه نشانگر SSR (A00I, A00II, A00II) معرفی شده برای شناسایی افراد نر و ماده، فقط نشانگر A00II با باند ویژه (230bp) در افراد نر و باند ویژه (219bp) در افراد ماده قادر به تفکیک جنسیت دانهال‌های کیوی فروت بود. دو نشانگر A00I و A00III در افراد نر و ماده الگوی باندی مشابه ظاهر نموده قادر به جدا سازی افراد از نظر جنسیت نبودند.نتیجه گیری: در مجموع، نتایج این پژوهش نشان داد که استفاده توام از نشانگرهای SmX, SmY1 و A00II با کمترین خطا قادر به تفکیک دانهال‌های نر و ماده کیوی‌فروت در مراحل اولیه نونهالی میباشند. |
| format | Article |
| id | doaj-art-ac4abaf25f6c4bfe923336b9ac5408b0 |
| institution | Kabale University |
| issn | 2322-2050 2322-2778 |
| language | fas |
| publishDate | 2020-08-01 |
| publisher | Gorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resources |
| record_format | Article |
| series | Pizhūhish/hā-yi tulīd-i giyāhī |
| spelling | doaj-art-ac4abaf25f6c4bfe923336b9ac5408b02025-01-25T06:57:53ZfasGorgan University of Agricultural Sciences and Natural ResourcesPizhūhish/hā-yi tulīd-i giyāhī2322-20502322-27782020-08-0127212113010.22069/jopp.2020.16255.24785114اعتبار سنجی برخی نشانگرهای مولکولی در تعیین جنسیت ژنوتیپ‌‌های مختلف کیوی فروت حاصل گرده افشانی آزادسونیا جمالی آنجلانی0محمود قاسم نژاد1حبیب الله سمیع زاده لاهیجی2یوسف حمیداوغلی3دانشجوی دکتری گروه علوم باغبانی، دانشگاه گیلاناستاد گروه علوم باغبانی، دانشگاه گیلاناستاد گروه بیوتکنولوژی، دانشگاه گیلاناستاد گروه علوم باغبانی، دانشگاه گیلانسابقه و هدف: کیوی‌فروت یکی از مهم‌ترین محصول باغی صادراتی ایران است. اما تمایل مشتریان بین المللی به خرید میوههای کیوی متفاوت از نظر رنگ گوشت و مزه افزایش یافته است، جهت ارتقای جایگاه کیوی ایران تولید ارقام جدید اهمیت دارد. یکی از موانع اصلاح نونهالی نسبتا طولانی و همچنین دوپایگی میباشد که تا قبل از گلدهی تفاوتی ظاهری دانهال نر و ماده وجود ندارد. بنابراین، تعیین جنسیت دانهالها و جداسازی افراد نر و ماده در کوتاهترین زمان اهمیت زیادی در برنامههای بهنژادی دارد. در این پژوهش اعتبارسنجی برخی از نشانگرهای مولکولی مرتبط با جنسیت جهت تفکیک دانهال‌های نر و ماده کیوی‌فروت حاصل از گرده افشانی آزاد مورد آزمون قرار گرفت. مواد و روشها: در این پژوهش از دو نوع ژنوتیپ کیوی‌فروت گوشت زرد (به اسامی نواب و خورشید) و یک نوع ژنوتیپ گوشت قرمز(خونی) که همگی متعلق به گونه Actinidia chinesis و دیپلوئید بودند، استفاده شد. استخراج DNA ژنومی از برگهای جوان 10 گیاه بالغ نر و ماده بالغ کیوی‌فروت به روش CTAB با کمی تغییرات صورت گرفت. برای تعیین دقیق غلظت DNA هر نمونه، از دستگاه اسپکتروفوتومتری (Biophotometra, Plus Eppendorff) استفاده می‌شود و غلظتDNA در طول موج 260 نانومتر ارزیابی شد. واکنش زنجیرهای پلیمراز (PCR) در حجم 10 میکرولیتر با استفاده از دستگاه برای هر نمونه انجام گرفت. برای هر پرایمر برنامه (PCR)، غلظت ژل آگارز و مدت زمان بارگذاری بهینه استفاده شد. در نهایت، اعتبار سنجی برخی از نشانگرهای مولکولی مرتبط با جنسیت شامل سه نشانگر SCAR (SmY, SmX و SmY1) و سه نشانگر SSR (A00I, A00II, A00II) در DNA استخراج شده از برگ ژنوتیپ‌‌های مورد آزمایش، مورد بررسی قرار گرفت. یافتهها: نتایج این پژوهش نشان داد از بین چندین نشانگر SCAR و SSR که قبلا گزارش شده بود، برخی قادر به جداسازی دقیق دانهال‌های نر و ماده کیوی‌فروت نبودند. از بین سه نشانگر SCAR (SmY, SmX و SmY1) که مورد آزمون قرار گرفتند، تنها دو نشانگر SmY1 (770 bp) در افراد نر(بدون ظهور هیچ باندی در افراد ماده) و در افراد ماده و SmX (950bp) در افراد ماده (بدون ظهور هیچ باندی در افراد نر) به خوبی قادر به جداسازی دانهال‌های کیوی‌فروت شدند. با توجه به نوارهای چندشکل بدست آمده از سه نشانگر SSR (A00I, A00II, A00II) معرفی شده برای شناسایی افراد نر و ماده، فقط نشانگر A00II با باند ویژه (230bp) در افراد نر و باند ویژه (219bp) در افراد ماده قادر به تفکیک جنسیت دانهال‌های کیوی فروت بود. دو نشانگر A00I و A00III در افراد نر و ماده الگوی باندی مشابه ظاهر نموده قادر به جدا سازی افراد از نظر جنسیت نبودند.نتیجه گیری: در مجموع، نتایج این پژوهش نشان داد که استفاده توام از نشانگرهای SmX, SmY1 و A00II با کمترین خطا قادر به تفکیک دانهال‌های نر و ماده کیوی‌فروت در مراحل اولیه نونهالی میباشند.https://jopp.gau.ac.ir/article_5114_7245d6da6588e13873132bbc30bba989.pdfاصلاحنونهالینشانگر تعیین جنسیتنشانگر ssrنشانگرscar |
| spellingShingle | سونیا جمالی آنجلانی محمود قاسم نژاد حبیب الله سمیع زاده لاهیجی یوسف حمیداوغلی اعتبار سنجی برخی نشانگرهای مولکولی در تعیین جنسیت ژنوتیپ‌‌های مختلف کیوی فروت حاصل گرده افشانی آزاد Pizhūhish/hā-yi tulīd-i giyāhī اصلاح نونهالی نشانگر تعیین جنسیت نشانگر ssr نشانگرscar |
| title | اعتبار سنجی برخی نشانگرهای مولکولی در تعیین جنسیت ژنوتیپ‌‌های مختلف کیوی فروت حاصل گرده افشانی آزاد |
| title_full | اعتبار سنجی برخی نشانگرهای مولکولی در تعیین جنسیت ژنوتیپ‌‌های مختلف کیوی فروت حاصل گرده افشانی آزاد |
| title_fullStr | اعتبار سنجی برخی نشانگرهای مولکولی در تعیین جنسیت ژنوتیپ‌‌های مختلف کیوی فروت حاصل گرده افشانی آزاد |
| title_full_unstemmed | اعتبار سنجی برخی نشانگرهای مولکولی در تعیین جنسیت ژنوتیپ‌‌های مختلف کیوی فروت حاصل گرده افشانی آزاد |
| title_short | اعتبار سنجی برخی نشانگرهای مولکولی در تعیین جنسیت ژنوتیپ‌‌های مختلف کیوی فروت حاصل گرده افشانی آزاد |
| title_sort | اعتبار سنجی برخی نشانگرهای مولکولی در تعیین جنسیت ژنوتیپ‌‌های مختلف کیوی فروت حاصل گرده افشانی آزاد |
| topic | اصلاح نونهالی نشانگر تعیین جنسیت نشانگر ssr نشانگرscar |
| url | https://jopp.gau.ac.ir/article_5114_7245d6da6588e13873132bbc30bba989.pdf |
| work_keys_str_mv | AT swnyạjmạlyậnjlạny ạʿtbạrsnjybrkẖynsẖạngrhạymwlḵwlydrtʿyynjnsytzẖnwtyphạymkẖtlfḵywyfrwtḥạṣlgrdhạfsẖạnyậzạd AT mḥmwdqạsmnzẖạd ạʿtbạrsnjybrkẖynsẖạngrhạymwlḵwlydrtʿyynjnsytzẖnwtyphạymkẖtlfḵywyfrwtḥạṣlgrdhạfsẖạnyậzạd AT ḥbybạllhsmyʿzạdhlạhyjy ạʿtbạrsnjybrkẖynsẖạngrhạymwlḵwlydrtʿyynjnsytzẖnwtyphạymkẖtlfḵywyfrwtḥạṣlgrdhạfsẖạnyậzạd AT ywsfḥmydạwgẖly ạʿtbạrsnjybrkẖynsẖạngrhạymwlḵwlydrtʿyynjnsytzẖnwtyphạymkẖtlfḵywyfrwtḥạṣlgrdhạfsẖạnyậzạd |