ДНК-идентификация сортов и видов козлятника (Galega) с применением SRAP-маркеров и рестрикционного анализа спейсера trnH–psbA
Козлятник широко используется в качестве лекарственного растения и на корм скоту, в биологическом земледе- лии и для получения биогаза. К настоящему времени в России создано 18 высокопродуктивных сортов козлятника восточно- го (Galega orientalis Lam.). Активная селекционная работа продолжается, о...
Saved in:
| Main Authors: | , , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | English |
| Published: |
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук»
2024-10-01
|
| Series: | Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции |
| Subjects: | |
| Online Access: | https://pismavavilov.ru/wp-content/uploads/2024/10/003-PVJ_Klimenko_10_3.pdf |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| _version_ | 1850203614671273984 |
|---|---|
| author | КлименкоИ.А. Антонов А.А. Шамустакимова А.О. Золотарев В.Н. |
| author_facet | КлименкоИ.А. Антонов А.А. Шамустакимова А.О. Золотарев В.Н. |
| author_sort | КлименкоИ.А. |
| collection | DOAJ |
| description | Козлятник широко используется в качестве лекарственного растения и на корм скоту, в биологическом земледе-
лии и для получения биогаза. К настоящему времени в России создано 18 высокопродуктивных сортов козлятника восточно-
го (Galega orientalis Lam.). Активная селекционная работа продолжается, однако отсутствуют надежные методы определения
сортовой и видовой принадлежности. Цель наших исследований состояла в изучении потенциала SRAP-маркеров и метода
рестрикционного анализа спейсера trnH–psbA для ДНК-идентификации сортов и видов рода Galega. Исследования по оценке
меж- и внутрисортового генетического полиморфизма проведены на выборке из российских сортов козлятника восточного,
включенных в Госреестр селекционных достижений Российской Федерации. С использованием восьми комбинаций SRAP-
праймеров получены 283 фрагмента амплифицированной ДНК, из которых 105 (37.1 %) оказались полиморфными. Эффектив-
ное число аллелей в среднем равнялось 1.37, показатель информационного содержания (PIC) – 0.787; средние значения ин-
дексов генетического разнообразия по Нею (He) и Шеннона (I) составили соответственно 0.25 и 0.41. Кластеризация образцов
методом главных координат разделила их на три группы в зависимости от происхождения и хозяйственного назначения при
возделывании в различных регионах. Для сортов Вест и Юбиляр, выделившихся уникальными, сортоспецифичными амплико-
нами, разработаны ДНК-паспорта. При амплификации с использованием практически всех комбинаций SRAP-праймеров вы-
явлены существенные отличия в ДНК-профиле сорта Еля-Ты в сравнении с другими изучаемыми образцами. Для уточнения
видовой принадлежности данного сорта был применен метод рестрикционного анализа ДНК-баркода trnH–psbA. Результаты
исследования показали, что SRAP-маркеры можно успешно использовать для оценки генетического разнообразия и сортовой
ДНК-идентификации козлятника восточного. Метод рестрикционного анализа спейсеров хлоропластной ДНК является эффек-
тивным подходом для различения видов в составе рода Galega. |
| format | Article |
| id | doaj-art-21de73061baa4dcd96779a045dbdf625 |
| institution | OA Journals |
| issn | 2686-8482 |
| language | English |
| publishDate | 2024-10-01 |
| publisher | Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук» |
| record_format | Article |
| series | Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции |
| spelling | doaj-art-21de73061baa4dcd96779a045dbdf6252025-08-20T02:11:28ZengФедеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук»Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции2686-84822024-10-0110314115010.18699/letvjgb-2024-10-16ДНК-идентификация сортов и видов козлятника (Galega) с применением SRAP-маркеров и рестрикционного анализа спейсера trnH–psbAКлименкоИ.А. 0https://orcid.org/0000-0002-1850-3859Антонов А.А. 1https://orcid.org/0000-0002-7684-0503Шамустакимова А.О. 2Золотарев В.Н.3Федеральный научный центр кормопроизводства и агроэкологии им. В.Р. Вильямса, Лобня, Московская область, РоссияФедеральный научный центр кормопроизводства и агроэкологии им. В.Р. Вильямса, Лобня, Московская область, РоссияФедеральный научный центр кормопроизводства и агроэкологии им. В.Р. Вильямса, Лобня, Московская область, РоссияФедеральный научный центр кормопроизводства и агроэкологии им. В.Р. Вильямса, Лобня, Московская область, Россия Козлятник широко используется в качестве лекарственного растения и на корм скоту, в биологическом земледе- лии и для получения биогаза. К настоящему времени в России создано 18 высокопродуктивных сортов козлятника восточно- го (Galega orientalis Lam.). Активная селекционная работа продолжается, однако отсутствуют надежные методы определения сортовой и видовой принадлежности. Цель наших исследований состояла в изучении потенциала SRAP-маркеров и метода рестрикционного анализа спейсера trnH–psbA для ДНК-идентификации сортов и видов рода Galega. Исследования по оценке меж- и внутрисортового генетического полиморфизма проведены на выборке из российских сортов козлятника восточного, включенных в Госреестр селекционных достижений Российской Федерации. С использованием восьми комбинаций SRAP- праймеров получены 283 фрагмента амплифицированной ДНК, из которых 105 (37.1 %) оказались полиморфными. Эффектив- ное число аллелей в среднем равнялось 1.37, показатель информационного содержания (PIC) – 0.787; средние значения ин- дексов генетического разнообразия по Нею (He) и Шеннона (I) составили соответственно 0.25 и 0.41. Кластеризация образцов методом главных координат разделила их на три группы в зависимости от происхождения и хозяйственного назначения при возделывании в различных регионах. Для сортов Вест и Юбиляр, выделившихся уникальными, сортоспецифичными амплико- нами, разработаны ДНК-паспорта. При амплификации с использованием практически всех комбинаций SRAP-праймеров вы- явлены существенные отличия в ДНК-профиле сорта Еля-Ты в сравнении с другими изучаемыми образцами. Для уточнения видовой принадлежности данного сорта был применен метод рестрикционного анализа ДНК-баркода trnH–psbA. Результаты исследования показали, что SRAP-маркеры можно успешно использовать для оценки генетического разнообразия и сортовой ДНК-идентификации козлятника восточного. Метод рестрикционного анализа спейсеров хлоропластной ДНК является эффек- тивным подходом для различения видов в составе рода Galega.https://pismavavilov.ru/wp-content/uploads/2024/10/003-PVJ_Klimenko_10_3.pdfкозлятник восточный;galega orientalis lamгенетическое разнообразие;srap-маркерыднк-полиморфизмгенетический паспортднк-баркодированиерестрикционный анализ |
| spellingShingle | КлименкоИ.А. Антонов А.А. Шамустакимова А.О. Золотарев В.Н. ДНК-идентификация сортов и видов козлятника (Galega) с применением SRAP-маркеров и рестрикционного анализа спейсера trnH–psbA Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции козлятник восточный; galega orientalis lam генетическое разнообразие; srap-маркеры днк-полиморфизм генетический паспорт днк-баркодирование рестрикционный анализ |
| title | ДНК-идентификация сортов и видов козлятника (Galega) с применением SRAP-маркеров и рестрикционного анализа спейсера trnH–psbA |
| title_full | ДНК-идентификация сортов и видов козлятника (Galega) с применением SRAP-маркеров и рестрикционного анализа спейсера trnH–psbA |
| title_fullStr | ДНК-идентификация сортов и видов козлятника (Galega) с применением SRAP-маркеров и рестрикционного анализа спейсера trnH–psbA |
| title_full_unstemmed | ДНК-идентификация сортов и видов козлятника (Galega) с применением SRAP-маркеров и рестрикционного анализа спейсера trnH–psbA |
| title_short | ДНК-идентификация сортов и видов козлятника (Galega) с применением SRAP-маркеров и рестрикционного анализа спейсера trnH–psbA |
| title_sort | днк идентификация сортов и видов козлятника galega с применением srap маркеров и рестрикционного анализа спейсера trnh psba |
| topic | козлятник восточный; galega orientalis lam генетическое разнообразие; srap-маркеры днк-полиморфизм генетический паспорт днк-баркодирование рестрикционный анализ |
| url | https://pismavavilov.ru/wp-content/uploads/2024/10/003-PVJ_Klimenko_10_3.pdf |
| work_keys_str_mv | AT klimenkoia dnkidentifikaciâsortovividovkozlâtnikagalegasprimeneniemsrapmarkerovirestrikcionnogoanalizaspejseratrnhpsba AT antonovaa dnkidentifikaciâsortovividovkozlâtnikagalegasprimeneniemsrapmarkerovirestrikcionnogoanalizaspejseratrnhpsba AT šamustakimovaao dnkidentifikaciâsortovividovkozlâtnikagalegasprimeneniemsrapmarkerovirestrikcionnogoanalizaspejseratrnhpsba AT zolotarevvn dnkidentifikaciâsortovividovkozlâtnikagalegasprimeneniemsrapmarkerovirestrikcionnogoanalizaspejseratrnhpsba |