بررسی چندشکلی ژنوتیپ‌های مرکبات با استفاده از نشانگر مولکولی رپید

شناسایی تنوع ژنتیکی و روابط خویشاوندی، برای دست‌یابی به ارقام مطلوب در مرکبات مهم و ضروری است. در این پژوهش از نشانگرRAPD جهت تعیین تنوع ژنتیکی میان 29 ژنوتیپ مرکبات استفاده شد. 19 آغاز‌گر استفاده شده تعداد 248 باند چند شکل ایجاد گردید که بیشترین باند تکثیر شده 19 عدد و مربوط به آغازگر OPA-07 بود، د...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Main Authors: هاجر عابدین پور, غلامعلی رنجبر, نادعلی بابائیان جلودار, بهروز گلعین
Format: Article
Language:fas
Published: Gorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resources 2015-02-01
Series:Pizhūhish/hā-yi tulīd-i giyāhī
Subjects:
Online Access:https://jopp.gau.ac.ir/article_2187_7700eede557e8b857a2e9828c2388a23.pdf
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
_version_ 1832586691928391680
author هاجر عابدین پور
غلامعلی رنجبر
نادعلی بابائیان جلودار
بهروز گلعین
author_facet هاجر عابدین پور
غلامعلی رنجبر
نادعلی بابائیان جلودار
بهروز گلعین
author_sort هاجر عابدین پور
collection DOAJ
description شناسایی تنوع ژنتیکی و روابط خویشاوندی، برای دست‌یابی به ارقام مطلوب در مرکبات مهم و ضروری است. در این پژوهش از نشانگرRAPD جهت تعیین تنوع ژنتیکی میان 29 ژنوتیپ مرکبات استفاده شد. 19 آغاز‌گر استفاده شده تعداد 248 باند چند شکل ایجاد گردید که بیشترین باند تکثیر شده 19 عدد و مربوط به آغازگر OPA-07 بود، در حالیکه آغازگر 05-OPA با هشت باند کمترین قطعات چندشکل را نشان داد. متوسط تعداد باند چند‌‌‌‌شکل برای هر آغازگر 13 باند بر‌آورد گردید. آنالیز داده‌ها توسط نرم افزار NTsys با استفاده از ضریب تشابه جاکارد، میزان تشابه محاسبه شده بر اساس باندهای چند‌شکل را در دامنه‌ای از 14/0 تا 97/0 با میانگین تشابه 62/0 نشان داد. تجزیه خوشه‌ای بر پایه ماتریس تشابه جاکارد و با روش UPGMA صورت گرفت. بر اساس تجزیه‌ خوشه ای، در ضریب تشابه 49/0 ژنوتیپ‌های مرکبات مورد مطالعه به پنج گروه تقسیم شدند. بر اساس ماتریس تشابه، کمترین شباهت (14/0) مربوط به دو ژنوتیپ پوملو و نارنگی محلی و بیشترین شباهت (97/0) مربوط به دو تیپ طبیعی ناشناخته G74 وG73 بود. با بررسی دندروگرام نشان داده شد که پوملو و نارنگی به عنوان گونه‌های حقیقی مرکبات در خوشه‌های مجزا قرار دارند. تعیین تنوع‌ ژنتیکی در مرکبات، اطلاعات مفیدی را برای برنامه‌های به‌نژادی، انتخاب و حفظ ارقام فراهم می کند.
format Article
id doaj-art-008a292c66464ac49403ab0004d49c64
institution Kabale University
issn 2322-2050
2322-2778
language fas
publishDate 2015-02-01
publisher Gorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resources
record_format Article
series Pizhūhish/hā-yi tulīd-i giyāhī
spelling doaj-art-008a292c66464ac49403ab0004d49c642025-01-25T06:48:10ZfasGorgan University of Agricultural Sciences and Natural ResourcesPizhūhish/hā-yi tulīd-i giyāhī2322-20502322-27782015-02-012141651782187بررسی چندشکلی ژنوتیپ‌های مرکبات با استفاده از نشانگر مولکولی رپیدهاجر عابدین پور0غلامعلی رنجبر1نادعلی بابائیان جلودار2بهروز گلعین3دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساریدانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساریدانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساریموسسه تحقیقات مرکبات رامسرشناسایی تنوع ژنتیکی و روابط خویشاوندی، برای دست‌یابی به ارقام مطلوب در مرکبات مهم و ضروری است. در این پژوهش از نشانگرRAPD جهت تعیین تنوع ژنتیکی میان 29 ژنوتیپ مرکبات استفاده شد. 19 آغاز‌گر استفاده شده تعداد 248 باند چند شکل ایجاد گردید که بیشترین باند تکثیر شده 19 عدد و مربوط به آغازگر OPA-07 بود، در حالیکه آغازگر 05-OPA با هشت باند کمترین قطعات چندشکل را نشان داد. متوسط تعداد باند چند‌‌‌‌شکل برای هر آغازگر 13 باند بر‌آورد گردید. آنالیز داده‌ها توسط نرم افزار NTsys با استفاده از ضریب تشابه جاکارد، میزان تشابه محاسبه شده بر اساس باندهای چند‌شکل را در دامنه‌ای از 14/0 تا 97/0 با میانگین تشابه 62/0 نشان داد. تجزیه خوشه‌ای بر پایه ماتریس تشابه جاکارد و با روش UPGMA صورت گرفت. بر اساس تجزیه‌ خوشه ای، در ضریب تشابه 49/0 ژنوتیپ‌های مرکبات مورد مطالعه به پنج گروه تقسیم شدند. بر اساس ماتریس تشابه، کمترین شباهت (14/0) مربوط به دو ژنوتیپ پوملو و نارنگی محلی و بیشترین شباهت (97/0) مربوط به دو تیپ طبیعی ناشناخته G74 وG73 بود. با بررسی دندروگرام نشان داده شد که پوملو و نارنگی به عنوان گونه‌های حقیقی مرکبات در خوشه‌های مجزا قرار دارند. تعیین تنوع‌ ژنتیکی در مرکبات، اطلاعات مفیدی را برای برنامه‌های به‌نژادی، انتخاب و حفظ ارقام فراهم می کند.https://jopp.gau.ac.ir/article_2187_7700eede557e8b857a2e9828c2388a23.pdfتجزیه‌ خوشه‌ایتنوع‌ ژنتیکیماتریس ‌تشابهمرکباتrapd
spellingShingle هاجر عابدین پور
غلامعلی رنجبر
نادعلی بابائیان جلودار
بهروز گلعین
بررسی چندشکلی ژنوتیپ‌های مرکبات با استفاده از نشانگر مولکولی رپید
Pizhūhish/hā-yi tulīd-i giyāhī
تجزیه‌ خوشه‌ای
تنوع‌ ژنتیکی
ماتریس ‌تشابه
مرکبات
rapd
title بررسی چندشکلی ژنوتیپ‌های مرکبات با استفاده از نشانگر مولکولی رپید
title_full بررسی چندشکلی ژنوتیپ‌های مرکبات با استفاده از نشانگر مولکولی رپید
title_fullStr بررسی چندشکلی ژنوتیپ‌های مرکبات با استفاده از نشانگر مولکولی رپید
title_full_unstemmed بررسی چندشکلی ژنوتیپ‌های مرکبات با استفاده از نشانگر مولکولی رپید
title_short بررسی چندشکلی ژنوتیپ‌های مرکبات با استفاده از نشانگر مولکولی رپید
title_sort بررسی چندشکلی ژنوتیپ‌های مرکبات با استفاده از نشانگر مولکولی رپید
topic تجزیه‌ خوشه‌ای
تنوع‌ ژنتیکی
ماتریس ‌تشابه
مرکبات
rapd
url https://jopp.gau.ac.ir/article_2187_7700eede557e8b857a2e9828c2388a23.pdf
work_keys_str_mv AT hạjrʿạbdynpwr brrsycẖndsẖḵlyzẖnwtyphạymrḵbạtbạạstfạdhạznsẖạngrmwlḵwlyrpyd
AT gẖlạmʿlyrnjbr brrsycẖndsẖḵlyzẖnwtyphạymrḵbạtbạạstfạdhạznsẖạngrmwlḵwlyrpyd
AT nạdʿlybạbạỷyạnjlwdạr brrsycẖndsẖḵlyzẖnwtyphạymrḵbạtbạạstfạdhạznsẖạngrmwlḵwlyrpyd
AT bhrwzglʿyn brrsycẖndsẖḵlyzẖnwtyphạymrḵbạtbạạstfạdhạznsẖạngrmwlḵwlyrpyd